女性下生殖道为开放性腔道，在育龄期健康女性正常阴道菌群中，以乳杆菌等优势菌为主组成的微生态动态平衡系统。阴道内正常存在的乳杆菌对维持阴道正常菌群起着关键的作用。

女性生殖道具有局部免疫系统，其中主要是阴道粘膜对微生物的免疫反应，可以分为非特异性免疫和特异性免疫。非特异性免疫主要包括屏障结构、吞噬细胞及细胞因子，其中阴道粘膜的屏障结构包括：①机械阻挡作用，完整的阴道黏膜可地防止细菌、真菌等微生物侵入体内。一旦阴道黏膜受损，阴道内的微生物便可黏附于宿主细胞。②弱酸性环境，多数病原菌生长的佳酸碱度是PH 7.2~7.6，阴道的弱酸环境不利于病原微生物的定居繁殖。③正常菌群拮抗作用。大量乳杆菌的存在会消耗大量的糖原，使其他微生物的营养介绍，生长受限制，保护宿主的阴道壁，使其不受其他微生物的侵害。但是阴道冲洗、性交等行为都可造成阴道黏膜轻微的破损，酸碱度改变，细胞因子被稀释等，从而破坏阴道的屏障作用。

在阴道局部情况异常的状态下，如果有致病微生物的入侵和大量繁殖，就会引发阴道的感染，常见的阴道感染有真菌感染外阴阴道念珠菌病，即俗称的真菌性阴道炎、细菌性阴道病、滴虫阴道炎、混合性阴道炎等。老年性阴道炎和幼女性阴道炎均为雌激素较低而引起的感染。以下情况有可能影响阴道生态系统平衡，出现异常状态：①性激素，如月经期前后雌激素降低，导致阴道内PH上升，有利于厌氧菌及一些微生物的生长。②避孕产品，某些杀精子的避孕药膏对乳杆菌有毒性作用。③药物，许多种药物如广谱抗菌类药物可杀灭或抑制乳杆菌，从而影响阴道的内环境。④感染，无保护性交的情况下，感染了性传播感染等。